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AbMole精研抑制剂十年,最新的科研动态不断与您分享。本期与您分享的是:高分辨率SSiNGLe-AP方法揭示了哺乳动物DNA中基本位点的复杂基因组模式。

DNA损伤在生物学和疾病中起着关键作用,然而,不同类型的DNA损伤如何影响细胞功能还远远不清楚,这主要是因为缺乏高分辨率的方法,可以绘制它们在复杂基因组中的位置,如哺乳动物的基因组。在这里,我们介绍了SSiNGLe-AP方法的开发和验证,该方法可以用全基因组和高分辨率的方式绘制一种常见的DNA损伤类型和基本位点(AP)。我们将该方法应用于6种不同年龄的小鼠和人类癌细胞株的不同组织。结果发现AP位点在哺乳动物基因组中的非随机分布,在特定的基因组位置(包括单核苷酸热点)表现出动态富集,特别是受基因表达、年龄和组织类型的显著影响。总的来说,这些结果表明,我们才刚刚开始了解DNA损伤基因组模式的真正复杂性。

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